МФО мають право застосовувати санкції до позичальників, які не вносять своєчасно платежі за кредитом. Це може бути пеня або штраф, розмір яких різниться від однієї фінустанови до іншої. Умови сплати позики та санкції за їх порушення фіксуються у кредитному договорі.